اصفهان نیز به عنوان پایتخت فرهنگی ایران از دیرباز دارالمؤمنین گردشگران بوده و با پیشینه غنی و برخورداری از مساجد بزرگ و مطرح از پایگاه‌های مهم شیعه در دنیا به حساب می‌آید که در بخش گردشگری مذهبی نیز مزیت‌های بی‌شماری دارد، در ادامه به برخی از جاذبه‌های گردشگری مذهبی اصفهان اشاره خواهیم کرد.
کلیسای گئورگ مقدس (نو جلفا)، کلیسای وانک، کلیسای وانک، مسجد چهارسوقی، مسجد آقانور، مسجدابوالمحسن، مسجد الیادران، مسجد ایلچی، مسجد بهشتی‌نژاد، مسجد پا درخت سوخته، مسجد تل عاشقان، مسجد جارچی، مسجد جامع جی، مسجد جامع هفت‌شویه، مسجد حاج رضا، مسجد حاج محمد جعفرآباده‌ای، مسجد حاج میرزا محمدصادق، مسجد حاج یونس، مسجد حسین‌بن‌علی، مسجد حکیم، مسجد خواجه روح‌الله، مسجد خیاط‌ها، مسجد درب جوباره، مسجد دروازه نو، مسجد دشتی، مسجد رحیم‌خان، مسجد رکن‌الملک، مسجد ساروتقی، مسجد سرخی، مسجد سید، مسجد شاه، مسجد شعیا و امامزاده اسماعیل، مسجد شهدای ابن‌سینا، مسجد شیخ علیخان زنگنه، مسجد شیخ لطف‌الله، مسجد شیره پزها، مسجد شیشه، مسجد شیشه‌گری، مسجد صفا، مسجد ظلمات و آرامگاه میرعماد، مسجد علی خوراسگان، مسجد علی‌قلی‌آقا، مسجد قصر منشی، مسجد قطبیه (حسینیه خلجا)، مسجد کرمانی (نوررضوان)، مسجد گنبد آزادان، مسجد لنبان، مسجد محله نو قلـعـه (حبیب)، مسجد مقصودبیـــک، مسجد نو بازار، مسجد و مدرسه شمـس‌آباد، مصلای اصفهان، آرامگاه ساروتقی اصفهان، تخت فولاد، آرامگاه ساروتقی اصفهان، آرامگاه علاءالدین شهشهان، نقیب‌النقبا، امامزاده اسماعیل، امامزاده شاه زید اصفهان، امامزاده هارون ولایت اصفهان، آرامگاه صاحب‌بن‌عباد اصفهان، آرامگاه میرعماد اصفهان، آرامگاه آقا محمد بیدآبادی اصفهان، آرامگاه واله اصفهان، آرامگاه شيخ ابومسعود رازی اصفهان، آرامگاه الراشد بالله اصفهان، آرامگاه علامه مجلسى اصفهان، آرامگاه علاءالدین شهشهان اصفهان، آرامگاه ابوالقاسم میرفندرسکی اصفهان، آرامگاه صائب تبریزی اصفهان، آرامگاه بابا رکن‌الدین اصفهان، منارجنبان اصفهان، مدرسه امام صادق چهارباغ، مدرسه ابراهیم‌بیک، مدرسه احمدآباد، مدرسه اسماعیلیه (محله قصرمنشی)، مدرسه الماسیه، مدرسه امامزاده اسماعیل، مدرسه جده بزرگ و جده کوچک، مدرسه جلالیه (دوره صفوی)، مدرسه حاج شیخ محمدعلی ثقةالاسلام، مدرسه خالصیه، مدرسه ذوالفقار، مدرسه رفیعیه سلیمانیه، مدرسه ساروتقی (دوره صفوی)، مدرسه سلیمانیه، مدرسه شفیعیه دردشت، مدرسه عربان (مدرسه آیت‌الله خادمی)، مدرسه علی‌قلی آقا، مدرسه کاسه‌گران، مدرسه مسجد حکیم، مدرسه ملا عبدالله، مدرسه میرزا حسین، مدرسه ناصریه، مدرسه نوریه، مدرسه نیم‌آورد، مدرسه هارونیه (مدرسه میرزا شاه حسین).